في التاسع عشر من مارس عام 1974 اتفق أعضاء نادي الخالدية (الذي تأسس عام 1969)، وأعضاء نادي البطين (الذي تأسس عام 1973)، والذين يقعان في حيين متجاورين بمدينة أبوظبي وتربط علاقات الصداقة الوطيدة بين شبابيهما، على الاندماج في بوتقة واحدة، ليكونا نادياً جديداً أكثر اتساعاً، قادراً على استيعاب أكبر عدد من الشباب لممارسة هواياتهم في مناخ تربوي يساعدهم على صقل مواهبهم وتتوفر فيه فرص أكبر للإبداع والتطور، وسمي هذا النادي باسم "نادي الجزيرة".
في عام 1974 تم تشكيل أول مجلس إدارة لنادي الجزيرة وكان برئاسة معالي محمد خليفة الكندي، والذي ظل رئيسا للنادي عام 1986 عندما تولى سمو الشيخ سلطان بن حمدان آل نهيان رئاسة المجلس لغاية 1992، وتولى المنصب بعده شقيقه سمو الشيخ راشد بن حمدان آل نهيان، الذي كان لاعباً في فريق كرة القدم بالنادي هو وشقيقه الأصغر سعيد بن حمدان آل نهيان.
تولي الشيخ سيف بن محمد بن بطي منصب رئاسة مجلس إدارة النادي في الفترة ما بين عامي 1988 و1994، ثم تلاه معالي خلفان غيث المحيربي في الفترة من العام 1995 إلى 1997، وخلفه سعادة حمد بن محمد بن بروك الفترة ما بين العامين 1998 و2000، حتى تم تعيين سعادة بطي بن محمد القبيسي لاعب وسط النادي السابق وعضو مجلس الإدارة السابق رئيساً لمجلس الإدارة في العام 2000.
في عام 2005 أصبح محمد ثاني مرشد الرميثي رئيسا لمجلس الإدارة وتحققت خلال فترة رئاسته العديد من الإنجازات، ثم تولي الشيخ محمد بن حمدان بن زايد آل نهيان منصب رئيس مجلس إدارة شركة النادي لكرة القدم، وفاز الفريق تحت رئاسته بألقاب الدوري وكاس صاحب السمو رئيس الدولة حفظه الله، وشارك في كأس العالم للأندية وحصل فيها على المركز الرابع. وحاليا يتولى معالي الدكتور سلطان الجابر منصبي نائب رئيس النادي ورئيس اللجنة التنفيذية لمجلس إدارة النادي.
كان لتولي سمو الشيخ حمدان بن زايد آل نهيان الرئاسة الفخرية للنادي ورئاسة هيئة الشرف، وتولي سمو الشيخ منصور بن زايد آل نهيان منصب رئيس النادي ونائب رئيس هيئة الشرف بالنادي، والمتابعة المباشرة الأثر الإيجابي في تطوير وصقل المهارات الفنية والرياضية، وترسيخها بشكل مستمر لدى اللاعبين، ودعم ذلك بالمنشآت الرياضية الحديثة التي كان أبرزها ملعب صاحب السمو الشيخ محمد بن زايد آل نهيان، وصالة الألعاب الجماعية المغطاة، ومباني الأكاديمية في منطقة الشوامخ بأبوظبي.
| دوري الخليج العربي | الأبطال: 2011، 2017، 2021 |
| كأس رئيس الدولة | الأبطال: 2011، 2012، 2016 |
| كأس الخليج العربي | الأبطال: 2010 |
| كأس الاتحاد الإماراتي | الأبطال: 2006 |
| كأس الأندية الخليجية الأبطال | الأبطال: 2007 |
| كأس العالم للأندية | المركز الرابع: 2017 |